Os grãos ou nozes infetados com A. flavus podem estar espalhados por todo o lote, por isso o design de amostragem é fundamental para reduzir a classificação errada de lotes. Embora os métodos de ensaio variem ligeiramente, os resultados podem ser muito mais impactados pela forma como a amostra é colhida e pelo tamanho dessa amostra.
A fim de assegurar que um teste demonstre a concentração exata da aflatoxina, o procedimento adequado de amostragem, o tamanho da amostra e a preparação da amostra são mais importantes do que o tipo de ensaio utilizado.
Estudos anteriores sobre o amendoim demonstraram que cerca de 80% da variação do resultado do ensaio está associada ao tamanho da amostra, 15% com a preparação da amostra e 5% com o método de ensaio.
