A qualidade do amendoim pode degradar-se se as nozes não forem secas ou armazenadas corretamente. O mau processamento e armazenamento também podem levar à aflatoxina, um subproduto do molde que causa cancro e atordoamento em humanos e animais.
Os agricultores devem arrancar as vagens das vinhas e secar as vagens numa lona do chão. Separar as amendoins partidas, moldadas ou danificadas por insetos nesta paragem é uma das formas mais impactantes de reduzir a contaminação por aflatoxina.
Depois de separar e destruir as nozes más, as boas nozes devem ser armazenadas numa área fria e seca com boa ventilação.