Los granos o las nueces infectados con A. flavus pueden estar dispersos por un lote, por lo que el diseño del muestreo es fundamental para reducir la clasificación errónea de los lotes. Aunque los métodos de prueba varían ligeramente, los resultados pueden verse mucho más afectados por la forma en que se toma la muestra y el tamaño de la misma.
Para garantizar que una prueba muestre la concentración exacta de aflatoxina, es más importante un procedimiento de muestreo adecuado, el tamaño de la muestra y su preparación que el tipo de prueba que se utilice.
Investigaciones anteriores sobre el cacahuete han demostrado que aproximadamente el 80% de la varianza en el resultado de la prueba está asociada con el tamaño de la muestra, el 15% con la preparación de la muestra y el 5% con el método de prueba.
